La popolazione della Terra, attaccata dagli abitanti del pianeta Gamilon, è costretta a rifugiarsi nel sottosuolo a causa anche dell'eccessiva radioattività. L'unica possibilità per gli umani è andare sul pianeta Iskandar e recuperare il Cosmo DNA, un complesso apparecchio in grado di eliminare la radioattività. Per compiere il viaggio viene la Yamato, una nave da battaglia della Seconda Guerra Mondiale che viene ribattezzata Argo.
